L’Université de Ngozi a, dès sa création, cherché à tisser des liens avec le milieu universitaire international afin d’optimiser la formation proposée aux étudiants et de développer ses activités de recherche.

-Un accord de coopération a été signé avec l’Université du Burundi à Bujumbura et l’Université Nationale du Rwanda à Butare. Dans ce cadre, des missions d’enseignements ont été organisées ainsi que des séminaires de recherche, notamment dans le domaine de l’agronomie et de l’économie rurale.

-Une coopération existe depuis plusieurs années entre l’Université de Vérone, L’hôpital de Ngozi et l’Université de Ngozi. L’Université de Vérone appuie l’hôpital en hommes et matériel, organise des missions d’enseignements dans la faculté des sciences infirmières. Dans le cadre de cette coopération, des stages pratiques d’étudiants infirmiers sont organisés à l’hôpital.