L’objectif du projet de formation de l’Université de Ngozi est d’assurer une formation supérieure dans des domaines correspondant particulièrement aux besoins du monde rural burundais. Première Université privée du pays, elle a également pour but de désengorger et de proposer une alternative à l’Université publique du Burundi. Cette dernière a été en effet tout au long de la crise soumise à la violence et aux déchirements communautaires qui ont ensanglanté le pays. Des étudiants des premières promotions de l’Université de Ngozi (sortie en 2003) avaient commencé leurs études à l’Université du Burundi qu’ils ont dû abandonner du fait de la guerre et du climat de peur régnant à Bujumbura, notamment à l’Université.

La mission à moyen et long terme de l’Université est de renforcer les possibilités de développement du Burundi, notamment l’intérieur du pays, en formant des cadres de qualité capables d’accompagner et d’encadrer la population burundaise.

L’Université accueille les étudiants de toutes les régions du pays mais aussi des étudiants rwandais et congolais, majoritairement originaires des régions Sud et Nord Kivu. L’objectif de l’Université est ainsi, au delà de la formation intellectuelle, de favoriser la coexistence et l’éducation à la paix entre les différents peuples et différentes communautés de la région africaine des Grands Lacs, particulièrement troublée depuis plus de trente ans.